2つのテキストファイルで異なる部分の行数をカウントするには

diffを取って,>で始まる行だけ抜き出して,その数を数えればいいのだろうか?

diff -bB FILE1.txt FILE2.txt | sed '/^[^>].*/d'

これで,> で始まる行だけ抜き出せるので,wc でカウントする.